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单细胞组学

SINGLE-CELL OMICS 


单细胞组学技术目前已经广泛应用于细胞谱系追踪、组织特异性和细胞特异性图谱构建、肿瘤免疫学与癌症遗传学等细胞分子生物学的多种领域。




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图1:单细胞测序(SCS)可以研究癌前病变的侵袭性、原发性肿瘤的克隆进化、肿瘤微环境、转移性扩散以及治疗耐药性



单细胞转录组

我们利用10XGenomics、微孔、DNBelab C平台以及流式分选平台,可以实现高效的细胞捕获,可以对于单细胞和单细胞核进行高通量测序。


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图2:多种单细胞转录组技术的比较


为了深入了解单细胞水平上的染色质的动态状态,我们可以使用单细胞转座酶可及的染色质测序(scATAC-seq)测量单个细胞中全基因组范围内的染色质可及性。


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图3:scATAC-seq 数据分析流程


为了同时了解细胞基因和细胞表面蛋白的表达,我们可以提供 CITE-seq 和 REAP-seq 技术。可以同时进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞表面蛋白质定性和定量,可以联合检测转录组和抗体衍生标签(ADT)。


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图4:CITE-seq 同时分析单细胞水平上的细胞转录组和细胞表面蛋白丰度


TCR和BCR是跨膜表面蛋白复合物,它们构成了适应性免疫受体库(AIRR)。AIRR序列可以通过V(D)J测序进行解析,随后进行比对和配对,筛选功能性适应性免疫受体。T细胞或B细胞的克隆型可以通过相同的V基因以及TCR的VJ和VDJCDR3的相同核酸序列来识别,或基于距离通过体细胞高频突变的BCR谱系重建分析框架来识别。我们可以利用新的计算方法识别新型AIR的特异性。


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图5:单细胞TCR测序流程。


通过联系组织学成像和空间定位测量,来解析细胞的特征和细胞在组织中的位置,有助于了解组织细胞对微环境的功能依赖性。


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图6:应用单细胞和空间转录组测序对小鼠大脑细胞类型的全面而精确的空间映射


单细胞蛋白组


我们提出最佳实验流程、质量控制和数据报告建议,帮助实现可靠的单细胞蛋白质组学定量。


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图7:单细胞蛋白组学平台


单细胞代谢组


通过流式细胞仪和液相质谱,我们可以帮助检测单一细胞的化学成分。


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图8:单细胞代谢组学工作流程