MICROBIOMICS 

我们利用16S 和ITS2 rRNA基因测序或16S和ITS2 扩增子测序可以确定细菌和真菌群落中不同分类单元的相对丰度，并进行目标组之间的比较。这种分析水平可以帮助评估随时间变化的整体微生物特征，或不同处理组之间的差异。

鸟枪法（Shotgun）宏基因组测序可用于群落分类分析（多样性和丰度）以及功能分析。这种复杂的技术可以对群落内所有生物的 DNA 并行测序（包括细菌、真菌和病毒以及其他微生物），具有高覆盖率并可以实现物种水平的检测，同时还可以提供微生物功能基因的附加信息。

图1：16S宏基因组测序流程

图2：Shotgun 宏基因组测序流程

检力康可以提供宏转录组测序服务，为微生物群落的基因表达及相关功能结果提供信息。我们的宏转录组测序服务依托于先进的高通量测序仪、测序策略和先进的生物信息学流程。

图3：微生物组、宏基因组学多样性和LEfSE分析方法

尽管短片段测序（例如 rRNA 基因的一个或几个可变区域）通常可以精确到属级别，而长片段测序全长RRNA操纵子可以提供关于微生物群组成的种级别信息。检力康利用 Pacbio 和 Nanopore 仪器开发了长读长测序技术来克服这些挑战。长读长测序能够生成数千个碱基对长度的读长，并且可以测序整个16S区域（v1v8/v1v9），而不仅仅是基因组的某个片段（如16Sv4或16Sv1v3）。

图4：Nanopore 仪器技术原理

图5：微生物代谢组分析流程