SPATIAL OMICS
空间组学同时检测细胞组织物理结构和分子特性,不仅要破译成千上万个细胞的分子特征,还要理解其空间环境如何影响 它们的行为。这方面的技术有望改变生物学的许多领域,革新我们对于病理学的认知。

图1:空间组学分析生物组织的分子组成和空间组织结构的主要步骤
空间转录组
检力康利用 STOmics 和10XGenomics Visum 平台可以从原始生理环境中的完整组织切片中获取基因表达信息。STOmics 具有专有的空间增强分辨组学测序(Stereo-seq)技术,在空间解析转录组分析领域处于领先地位。它结合了原位捕获与 DNB-seq 技术,每10毫米距离可提供多达20000个用于组织RNA捕获的点,因此 STOmics 可以展示出比其他原位捕获技 术更高的分辨率和更广阔的视野。

图2:不同尺寸的 Stereo-seq 芯片可以满足各种研究需求
10XGenomics Visum 检测是空间转录组检测的更新版本。在载玻片的每个捕获区域中,大约有5000个带条形码的点,这 些点又包含数百万个带空间条形码的捕获寡核苷酸。每个带条形码的点直径为55微米,点与点之间的中心距离约为100微 米。平均来说,每个点捕获1到10个细胞的mRNA,提供了接近单细胞的分辨率。

图3:Visium 空间基因表达技术通过在组织的高分辨率显微图像上映射基因表达分析研究 FFPE 组织切片的全转录组
空间蛋白组
检力康利用 Hyperion IMC 技术和 CyTOF 等仪器,可以在同一张切片上同时检测几十种蛋白标记。

图4:通过 Hyperion XTi 加载器,我们可以实现新的通量和效率水平,可选的切片加载器 支持自动加载和采集多达 40 片切片
空间代谢组
我们利用MALDI/DESI 质谱影像技术,可以精确定位代谢物在特定细胞器、细胞、组织中的位置。

图5:空间质谱可以直接在组织切片中可视化和定量分析目标或非目标化学物质的分布
人工智能和空间组学
用人工智能可以将空间组学检测的分辨率提高到接近单细胞水平,可以将单细胞组学与空间组学整合在一起。

图6:我们利用深度学习分析空间组学数据